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关于相似術語，请见「系統分類學」。
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生物分类学
分类阶元
域界门纲
目科属种
三域系統
细胞生物
古菌域
细菌域
真核域
其他话题
二名法
“非细胞生物”
病毒
生物演化樹
查论编
生物分類學（英語：biotaxonomy）簡稱分類学（taxonomy），是关于生物个体的鉴定（identification）、归类（classification）和命名（nomenclature）的原理和方法的学科；此三要件间有相互依存的关系。生物分類學範圍包括：研究生物类群间的异同程度，阐明生物间的亲缘关系、演化过程和发展规律。[1]
要將生物分類，首先要知道生物與非生物的定義，但是我們似乎沒有辦法準確定義，以病毒來說，雖然可在其他生物體內寄生並複製，但在生物體外卻沒有一般生物的特徵如製造或攝取營養，生殖等現象。又如引起瘋牛病的朊粒（prion）可以造成感染卻無DNA成分，一直以來，DNA被視為生命遺傳物質，經由與RNA的轉錄轉譯過程，形成蛋白質，再進一步形成組成細胞的各個部分，如細胞膜、胞器等，而細胞則是我們長久以來所認為組成生命體的最小單位。
生物命名规范[编辑]
关于如何为生物命名的原则有很多国际协议，例如《国际植物命名法规》（International Code of Botanical Nomenclature，简称ICBN）、《国际动物命名法规》（International Code of Zoological Nomenclature，简称ICZN）以及《国际细菌命名法规（英语：International Code of Nomenclature of Bacteria）》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）。第四版的生物命名法规（BioCode）草案在2000年出版，它试图在5个领域标准化命名，但现在还没有被正式采纳。《国际病毒命名和分类法规》（International Code of Virus Classification and Nomenclature，简称ICVCN）是属于生物命名法规的。
生物分界(kingdom)和域(domain)[编辑]
传统上，生物分为五界(kingdom)，
原核生物界(bacteria) -- 原生生物界(protista) -- 真菌界(fungus) -- 植物界(plant) -- 动物界(animal)
Copeland提出过四界说：
原核生物界 -- 原生生物界 -- 植物界 -- 动物界
也有人使用三域系統说。这种分类方法是依據细胞是否有核以及细胞膜和细胞壁的差异。
古菌域(archaea) -- 细菌域(bacteria) -- 真核域(eukaryota)
另有一些不属于上述所有分类的介于生物和非生物之间的生命形式，即只能寄生于细胞内的病毒，而它们在细胞外并不表现出活跃的生命形式。
病毒 -- 类病毒 -- 朊粒
卡尔·林奈1735[2]
恩斯特·海克尔1866[3]
埃德·查頓（英语：Édouard Chatton）1925[4]
赫伯特·科普蘭1938[5]
罗伯特·魏泰克1969[6]
卡尔·乌斯 et al.1990[7]
湯瑪斯·卡弗利爾-史密斯1998[8]
2 界
3 界
2域系統（英语：two-empire system）
界 (生物)
界 (生物)
三域系統
界 (生物)
（未論述）
原生生物
原核生物
原核生物界
原核生物界
细菌
细菌
古菌
真核生物
原生生物
原生生物
真核生物
原生動物
色藻界
植物
植物
植物
植物
植物
真菌
真菌
动物
动物
动物
动物
动物
演化生物学约翰·古尔德繪製的達爾文雀圖像
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維基分類
相關條目（英语：Index of evolutionary biology articles）
词汇表（英语：Glossary of genetics and evolutionary biology）查论编
分类表[编辑]
生物分類總表[编辑]
主条目：生物分類總表
这个列表以NCBI Taxonomy （页面存档备份，存于互联网档案馆）上的分類爲基礎[註 1]。
生物詳細分類表[编辑]
古菌分類表
細菌分類表
植物分類表 (NCBI)
动物分类表
真菌分类表
原生生物分类表
古菌域[编辑]
主条目：古菌分類表
包含嗜鹽菌、一些超嗜熱菌、嗜酸菌等。
細菌域[编辑]
主条目：細菌分類表
包含放線菌、衣原體、支原體、立克次體等。
真核生物域[编辑]
植物界[编辑]
主条目：植物分類表 (NCBI)
包含綠藻、輪藻、苔蘚植物、蕨類植物、種子植物等。
真菌/後生動物組[编辑]
真菌/後生動物組除動物界和真菌外，還包含領鞭毛蟲、魚醉菌等。
動物界[编辑]
主条目：動物分類表
即“後生動物”組。
真菌界[编辑]
主条目：真菌分類表
包括子囊菌、擔子菌、接合菌、壺菌、聚合菌和微孢子蟲。
其餘真核生物（原生生物和真核藻類）[编辑]
真核生物除動物、植物、真菌三界之外統稱原生生物，爲並系群。
等輻骨蟲綱（Acantharea），如等棘蟲。
放射蟲綱
雙滴蟲類（Diplomonadida），如曲滴蟲、賈第蟲。
Parabasalidea
毛滴蟲綱（Trichomonada）
超鞭毛綱（Hypermastigia）
異葉足綱（Heterolobosea），如集胞菌。
眼蟲門
動質體目（Kinetoplastida）
眼蟲綱
隱藻綱（Cryptophyta）
定鞭藻綱（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。
不等鞭毛類，除下列分類還包括輻球蟲、蛙片蟲等。
金藻綱
硅鞭藻綱（Dictyochophyceae）
針胞藻綱（Raphidophyceae）
前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes）
卵菌綱
褐藻門，如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。
硅藻門
黃藻門
囊泡蟲類
頂複門，如瘧原蟲。
纖毛蟲類，如喇叭蟲、中縊蟲、榴彈蟲、草履蟲、四膜蟲。
甲藻門
單孢子蟲門（Haplosporidia）
絲足蟲類
根腫菌類（Plasmodiophorida）
粒網足蟲類（Granuloreticulosea），如有孔蟲。
葉足綱（Lobosea），如變形蟲（阿米巴）。
黏菌門
灰胞藻綱（Glaucocystophyceae）
紅藻門，如石花菜、紫菜。
註：以上真核生物列表不完全，尚包括有其他一些未歸類原生生物。
参见[编辑]
生物学主题
进化生物学、系统生物学
亚里士多德：《工具论》
林奈：双名法
创造分类学
注释[编辑]
^ 其它中文維基分類表可能依照其它標準，請注意區別。
参考文献[编辑]
^ 中国大百科智慧藏：分类学. [2019-07-30]. （原始内容存档于2020-10-06）.
^ Linnaeus, C. Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematics proposita per classes, ordines, genera & species. 1735.
^ Haeckel, E. Generelle Morphologie der Organismen. Reimer, Berlin. 1866.
^ Chatton, É. Pansporella perplexa. Réflexions sur la biologie et la phylogénie des protozoaires. Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale. 1925, 10–VII: 1–84.
^ Copeland, H. The kingdoms of organisms. Quarterly Review of Biology. 1938, 13: 383–420. doi:10.1086/394568.
^ Whittaker, R. H. New concepts of kingdoms of organisms. Science. January 1969, 163 (3863): 150–60. Bibcode:1969Sci...163..150W. PMID 5762760. doi:10.1126/science.163.3863.150.
^ Woese, C.; Kandler, O.; Wheelis, M. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1990, 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. PMC 54159 . PMID 2112744. doi:10.1073/pnas.87.12.4576.
^ Cavalier-Smith, T. A revised six-kingdom system of life. Biological Reviews. 1998, 73 (03): 203–66. PMID 9809012. doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x.
查论编生物分类学（科學分類法）分類階層
域
界
门
纲
目
科
属
种
亚种
林奈氏分類系統
非細胞生物
原核生物
真核生物
动物
真菌
植物
原生生物
藻类
五界說
原核生物界
原生生物界
真菌界
植物界
動物界
四界法
菌界
原生生物界
植物界
動物界
三域系統
細菌域
古菌域
真核域
親緣分支分類法
系統發生樹
查论编系统发生學相关领域
计算系统发生学（英语：Computational phylogenetics）
分子系统发生学
支序系統學
生物分类学
系統分類學
演化分类学（英语：Evolutionary taxonomy）
基本概念
系統發生（分支發生（英语：Cladogenesis））
系統發生樹（支序图）
演化網路
長枝吸引效應
演化支和演化级（英语：Evolutionary grade）
谱系（英语：Lineage (evolution)）（幽灵谱系（英语：Ghost lineage））
幽靈种群（英语：Ghost population）
推理方法
最大簡約法
概率法（最大似然估计
贝叶斯法）
距離矩陣法（英语：Distance matrices in phylogeny）（邻接法
不加權算術平均連鎖法（英语：UPGMA）
最小二乘法（英语：Least squares inference in phylogeny））
三元分析（英语：Three-taxon analysis）
系统发生包圍法（英语：Phylogenetic bracketing）
系统发生和解（英语：Phylogenetic reconciliation）
多物种溯祖过程
前沿课题
生物谱系命名法（英语：Phylogenetic nomenclature）（《国际系统发生命名法规（英语：PhyloCode）》）
DNA 条形码
系统发生比较方法（英语：Phylogenetic comparative methods）
系统发生生态位保守性（英语：Phylogenetic niche conservatism）
系統發生信號（英语：Phylogenetic signal）
系统发生软件（英语：List of phylogenetics software）
系统发生基因组学（英语：Phylogenomics）
系统发生生物地理学
類群特徵
原始特徵（英语：Primitive (phylogenetics)）（祖徵／共有祖徵（英语：Plesiomorphy and symplesiomorphy））
衍生特徵（衍徵／共有衍徵
自有衍徵（英语：Autapomorphy））
類群性質
单系群
並系群
多系群（複系群）
其他術語
冠群／幹群／泛群（總群）
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外群
基群
超樹（英语：Supertree）
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纪念
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